共享文献库构建

共享文献库的原始文件存放在 documents/papers路径下。该文献仓库的一级子目录为实验室成员的user_id

Labridge基于Parse获得的文献内容与信息构建充分翔实的共享文献库，以支持多种方式的检索。

共享文献向量数据库：

Labridge为所有的共享文献构建向量数据库(VectorIndex)，并记录每篇文献的Metadata，以及该文献的所有者。 内容向量数据库的构建参见源码文档 Func_modules.paper.store.shared_paper_store

共享文献向量数据库的结构如下图所示。该数据库为树形结构，第一层子节点为不同的用户，每个用户节点下会依照原始文献库中的目录树构建相应的 目录节点。文献节点记录该文献原始文件的相对路径，以及额外的Metadata如Abstract, Summary, Authors, Title 等等。 最后的叶子节点为每篇文献内容的文本块，前后文本块之间会有一定交叠。

内容总结：

Labridge会使用 LLM 对加入共享文献库的每一篇文献的MainText部分与Methods部分进行总结，并构建相应的Summary向量数据库(SummaryVectorIndex)。 对于MainText与Methods进行总结的侧重点不一样。对于MainText的总结侧重于文章的整体内容，主要创新点等； 对于Methods的总结侧重于文章使用的技术路径。

• 内容总结的具体细节参见 源码文档 Func_modules.paper.synthesizer.summarize
• 与Summary向量数据库相关的细节参见 源码文档 Func_modules.paper.store.paper_store
• MainText, Methods总结相关提示词参见 源码 func_modules.paper.prompt.synthesize.paper_summarize

文献目录总结：

Labridge使用 LLM 递归地为文献仓库的每一级目录生成该目录的文献简介，如每个目录下文献涉及的研究领域等。 这些信息会作为Labridge为实验室成员推荐文献以及向共享文献库插入新文献的重要参考。 文献目录总结的具体细节参见 源码文档 Func_modules.paper.store.paper_store

共享文献笔记向量数据库

共享文献笔记向量数据库的结构如下图所示。该数据库是一个较为扁平化的树形结构，第一层节点为文献的DOI，对应一份独一无二的文献，其子节点为 不交叠的内容文本块，且文本块长度较短，以提供精细化的检索。每个文本块节点的子节点为笔记节点，记录该文本块中用户记录的笔记内容。